دعاى آن حضرت در استغفار در سحر هر شب بعد از نافله نماز صبح

خدايا! از تو طلب آمرزش مى كنم براى آنچه از آنها بسويت توبه كردم و دوباره مرتكب آن گرديدم، و از تو طلب آمرزش مى كنم براى آنچه قصدم انجام خالصانه آن بود اما امور ديگرى در آن وارد شد كه منسوب به تو نمى باشد، و از تو طلب آمرزش مى كنم براى نعمتهايى كه به من ارزانى داشتى و با آنها در انجام گناهان يارى جستم.

آمرزش مى خواهم از خدائى كه معبودى جز او نمى باشد، زنده و پابرجاست، داناى غيب و شهود و بخشنده و مهربان است، براى هر گناهى كه انجام داده و هر نافرمانى كه مرتكب گرديدم.

خدايا! به من عقلى كامل، و تصميمى قوى، و دركى برتر، و قلبى پاك، و دانشى بسيار، و ادبى ارزشمند ارزانى دار، و آنها را بسود من و نه به ضرر من مقدر فرما، به رحمتت اى مهربانترين مهربانان.

آنگاه پنج بار بگو:

آمرزش مى خواهم از خدائى كه معبودى جز او نمى باشد، زنده و پابرجاست، و بسوى او توبه مى كنم.

دعاؤه في سحر كل ليله عقيب ركعتي الفجر

اَللَّهُمَّ اِنَّ ذُنُوبي وَ اِنْ كانَتْ فَظيعَةً فَاِنّي ما اَرَدْتُ بِها قَطيعَةً وَ لا اَقُولُ لَكَ الْعُتْبى لا اَعُودُ، بِما اَعْلَمُهُ مِنْ خُلْفي، وَ لا اَسْتَتِمُّ التَّوْبَةَ، لِما اَعْلَمُهُ مِنْ ضَعْفي، وَ قَدْ جِئْتُ اَطْلُبُ عَفْوَكَ وَ وَسيلَتي اِلَيْكَ كَرَمُكَ، فَصَلِّ عَلى مُحَمَّدٍ وَ الِ مُحَمَّدٍ وَ اَكْرِمْني، بِمَغْفِرَتِكَ يا اَرْحَمَ الرَّاحِمينَ.

ثم قل ثلاثمائة مرّة: اَلْعَفْوَ.